Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc96Q9CR92 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc96Q9CR92 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc96Q9CR92 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc96Q9CR92 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc96Q9CR92 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc96Q9CR92 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc96Q9CR92 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc96Q9CR92 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc96Q9CR92 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc96Q9CR92 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc96Q9CR92 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc96Q9CR92 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc96Q9CR92 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc96Q9CR92 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc96Q9CR92 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc96Q9CR92 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc96Q9CR92 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc96Q9CR92 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc96Q9CR92 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc96Q9CR92 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc96Q9CR92 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc96Q9CR92 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc96Q9CR92 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc96Q9CR92 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc96Q9CR92 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc96Q9CR92 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc96Q9CR92 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc96Q9CR92 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc96Q9CR92 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc96Q9CR92 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc96Q9CR92 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc96Q9CR92 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc96Q9CR92 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc96Q9CR92 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc96Q9CR92 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc96Q9CR92 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc96Q9CR92 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc96Q9CR92 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc96Q9CR92 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc96Q9CR92 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc96Q9CR92 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc96Q9CR92 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc96Q9CR92 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc96Q9CR92 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc96Q9CR92 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc96Q9CR92 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc96Q9CR92 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc96Q9CR92 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc96Q9CR92 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc96Q9CR92 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc96Q9CR92 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc96Q9CR92 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc96Q9CR92 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms