Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkiras2Q9CR56 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkiras2Q9CR56 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkiras2Q9CR56 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkiras2Q9CR56 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkiras2Q9CR56 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkiras2Q9CR56 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkiras2Q9CR56 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkiras2Q9CR56 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkiras2Q9CR56 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkiras2Q9CR56 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkiras2Q9CR56 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkiras2Q9CR56 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkiras2Q9CR56 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkiras2Q9CR56 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkiras2Q9CR56 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkiras2Q9CR56 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkiras2Q9CR56 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkiras2Q9CR56 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nkiras2Q9CR56 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkiras2Q9CR56 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms