Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CR55 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CR55 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CR55 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CR55 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CR55 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CR55 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CR55 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CR55 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CR55 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CR55 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CR55 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CR55 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9CR55 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9CR55 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CR55 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CR55 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CR55 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CR55 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CR55 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CR55 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CR55 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CR55 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CR55 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CR55 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CR55 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CR55 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CR55 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CR55 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CR55 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CR55 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CR55 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CR55 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CR55 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CR55 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CR55 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CR55 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CR55 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CR55 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CR55 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CR55 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CR55 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CR55 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CR55 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CR55 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CR55 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CR55 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CR55 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CR55 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CR55 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q9CR55 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CR55 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CR55 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CR55 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CR55 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q9CR55 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CR55 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CR55 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CR55 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CR55 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CR55 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CR55 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CR55 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CR55 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CR55 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CR55 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CR55 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CR55 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CR55 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CR55 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CR55 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CR55 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Q9CR55 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CR55 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CR55 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CR55 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CR55 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CR55 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CR55 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CR55 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CR55 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CR55 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CR55 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CR55 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CR55 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CR55 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CR55 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CR55 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CR55 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CR55 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CR55 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CR55 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CR55 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CR55 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CR55 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9CR55 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9CR55 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9CR55 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9CR55 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9CR55 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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