Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NmbQ9CR53 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NmbQ9CR53 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NmbQ9CR53 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NmbQ9CR53 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NmbQ9CR53 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NmbQ9CR53 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NmbQ9CR53 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NmbQ9CR53 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NmbQ9CR53 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NmbQ9CR53 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NmbQ9CR53 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NmbQ9CR53 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NmbQ9CR53 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NmbQ9CR53 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NmbQ9CR53 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NmbQ9CR53 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NmbQ9CR53 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NmbQ9CR53 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NmbQ9CR53 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms