Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm16286Q9CQX6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm16286Q9CQX6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm16286Q9CQX6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm16286Q9CQX6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm16286Q9CQX6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm16286Q9CQX6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16286Q9CQX6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16286Q9CQX6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16286Q9CQX6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16286Q9CQX6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm16286Q9CQX6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm16286Q9CQX6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm16286Q9CQX6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm16286Q9CQX6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm16286Q9CQX6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm16286Q9CQX6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm16286Q9CQX6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm16286Q9CQX6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm16286Q9CQX6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16286Q9CQX6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16286Q9CQX6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16286Q9CQX6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16286Q9CQX6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16286Q9CQX6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm16286Q9CQX6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm16286Q9CQX6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm16286Q9CQX6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm16286Q9CQX6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm16286Q9CQX6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm16286Q9CQX6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm16286Q9CQX6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm16286Q9CQX6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm16286Q9CQX6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm16286Q9CQX6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm16286Q9CQX6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm16286Q9CQX6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm16286Q9CQX6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm16286Q9CQX6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm16286Q9CQX6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm16286Q9CQX6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm16286Q9CQX6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm16286Q9CQX6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm16286Q9CQX6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm16286Q9CQX6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm16286Q9CQX6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm16286Q9CQX6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm16286Q9CQX6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm16286Q9CQX6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm16286Q9CQX6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm16286Q9CQX6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm16286Q9CQX6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm16286Q9CQX6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm16286Q9CQX6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm16286Q9CQX6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm16286Q9CQX6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gm16286Q9CQX6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm16286Q9CQX6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm16286Q9CQX6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm16286Q9CQX6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm16286Q9CQX6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm16286Q9CQX6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm16286Q9CQX6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm16286Q9CQX6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm16286Q9CQX6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm16286Q9CQX6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm16286Q9CQX6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm16286Q9CQX6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm16286Q9CQX6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm16286Q9CQX6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm16286Q9CQX6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm16286Q9CQX6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm16286Q9CQX6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm16286Q9CQX6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm16286Q9CQX6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm16286Q9CQX6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm16286Q9CQX6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm16286Q9CQX6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm16286Q9CQX6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm16286Q9CQX6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm16286Q9CQX6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm16286Q9CQX6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm16286Q9CQX6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1135.7 ms