Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gkn2Q9CQS6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gkn2Q9CQS6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gkn2Q9CQS6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gkn2Q9CQS6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gkn2Q9CQS6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gkn2Q9CQS6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gkn2Q9CQS6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gkn2Q9CQS6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gkn2Q9CQS6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gkn2Q9CQS6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gkn2Q9CQS6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gkn2Q9CQS6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gkn2Q9CQS6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gkn2Q9CQS6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gkn2Q9CQS6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gkn2Q9CQS6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gkn2Q9CQS6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gkn2Q9CQS6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gkn2Q9CQS6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gkn2Q9CQS6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gkn2Q9CQS6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gkn2Q9CQS6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gkn2Q9CQS6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gkn2Q9CQS6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gkn2Q9CQS6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms