Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smim8Q9CQQ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim8Q9CQQ0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim8Q9CQQ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim8Q9CQQ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smim8Q9CQQ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smim8Q9CQQ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smim8Q9CQQ0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smim8Q9CQQ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smim8Q9CQQ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim8Q9CQQ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smim8Q9CQQ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smim8Q9CQQ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim8Q9CQQ0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim8Q9CQQ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms