Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM2

Kdelr2, ER lumen protein-retaining receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr2Q9CQM2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kdelr2Q9CQM2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdelr2Q9CQM2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdelr2Q9CQM2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdelr2Q9CQM2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdelr2Q9CQM2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdelr2Q9CQM2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdelr2Q9CQM2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdelr2Q9CQM2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdelr2Q9CQM2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdelr2Q9CQM2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdelr2Q9CQM2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdelr2Q9CQM2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdelr2Q9CQM2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdelr2Q9CQM2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdelr2Q9CQM2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdelr2Q9CQM2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdelr2Q9CQM2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdelr2Q9CQM2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdelr2Q9CQM2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdelr2Q9CQM2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdelr2Q9CQM2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdelr2Q9CQM2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdelr2Q9CQM2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdelr2Q9CQM2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdelr2Q9CQM2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdelr2Q9CQM2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdelr2Q9CQM2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdelr2Q9CQM2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdelr2Q9CQM2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdelr2Q9CQM2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdelr2Q9CQM2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdelr2Q9CQM2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdelr2Q9CQM2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdelr2Q9CQM2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdelr2Q9CQM2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdelr2Q9CQM2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdelr2Q9CQM2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdelr2Q9CQM2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdelr2Q9CQM2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdelr2Q9CQM2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdelr2Q9CQM2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdelr2Q9CQM2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdelr2Q9CQM2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdelr2Q9CQM2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdelr2Q9CQM2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdelr2Q9CQM2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdelr2Q9CQM2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdelr2Q9CQM2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdelr2Q9CQM2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms