Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nicn1Q9CQM0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nicn1Q9CQM0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nicn1Q9CQM0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nicn1Q9CQM0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nicn1Q9CQM0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nicn1Q9CQM0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nicn1Q9CQM0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nicn1Q9CQM0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nicn1Q9CQM0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nicn1Q9CQM0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nicn1Q9CQM0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nicn1Q9CQM0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nicn1Q9CQM0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nicn1Q9CQM0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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