Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Higd2aQ9CQJ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd2aQ9CQJ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd2aQ9CQJ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Higd2aQ9CQJ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms