Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpd52l3Q9CQ14 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpd52l3Q9CQ14 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpd52l3Q9CQ14 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpd52l3Q9CQ14 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpd52l3Q9CQ14 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpd52l3Q9CQ14 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpd52l3Q9CQ14 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpd52l3Q9CQ14 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpd52l3Q9CQ14 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpd52l3Q9CQ14 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpd52l3Q9CQ14 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpd52l3Q9CQ14 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trpd52l3Q9CQ14 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpd52l3Q9CQ14 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpd52l3Q9CQ14 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpd52l3Q9CQ14 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpd52l3Q9CQ14 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpd52l3Q9CQ14 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpd52l3Q9CQ14 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpd52l3Q9CQ14 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpd52l3Q9CQ14 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpd52l3Q9CQ14 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms