Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc4Q99PH1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc4Q99PH1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc4Q99PH1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc4Q99PH1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc4Q99PH1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc4Q99PH1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc4Q99PH1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc4Q99PH1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc4Q99PH1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc4Q99PH1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc4Q99PH1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc4Q99PH1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc4Q99PH1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc4Q99PH1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc4Q99PH1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc4Q99PH1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc4Q99PH1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc4Q99PH1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc4Q99PH1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrc4Q99PH1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc4Q99PH1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc4Q99PH1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc4Q99PH1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc4Q99PH1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc4Q99PH1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc4Q99PH1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc4Q99PH1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc4Q99PH1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc4Q99PH1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc4Q99PH1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc4Q99PH1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc4Q99PH1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc4Q99PH1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc4Q99PH1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms