Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pcgf6Q99NA9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pcgf6Q99NA9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pcgf6Q99NA9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Pcgf6Q99NA9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Pcgf6Q99NA9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Pcgf6Q99NA9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pcgf6Q99NA9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pcgf6Q99NA9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pcgf6Q99NA9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pcgf6Q99NA9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Pcgf6Q99NA9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pcgf6Q99NA9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pcgf6Q99NA9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pcgf6Q99NA9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pcgf6Q99NA9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Pcgf6Q99NA9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Pcgf6Q99NA9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Pcgf6Q99NA9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pcgf6Q99NA9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Pcgf6Q99NA9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pcgf6Q99NA9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pcgf6Q99NA9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pcgf6Q99NA9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pcgf6Q99NA9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pcgf6Q99NA9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pcgf6Q99NA9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pcgf6Q99NA9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pcgf6Q99NA9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pcgf6Q99NA9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Pcgf6Q99NA9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Pcgf6Q99NA9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Pcgf6Q99NA9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Pcgf6Q99NA9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcgf6Q99NA9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcgf6Q99NA9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcgf6Q99NA9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcgf6Q99NA9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcgf6Q99NA9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Pcgf6Q99NA9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pcgf6Q99NA9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pcgf6Q99NA9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pcgf6Q99NA9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Pcgf6Q99NA9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Pcgf6Q99NA9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pcgf6Q99NA9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pcgf6Q99NA9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Pcgf6Q99NA9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pcgf6Q99NA9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pcgf6Q99NA9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pcgf6Q99NA9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pcgf6Q99NA9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Pcgf6Q99NA9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pcgf6Q99NA9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Pcgf6Q99NA9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Pcgf6Q99NA9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pcgf6Q99NA9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pcgf6Q99NA9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pcgf6Q99NA9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pcgf6Q99NA9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pcgf6Q99NA9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Pcgf6Q99NA9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Pcgf6Q99NA9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Pcgf6Q99NA9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Pcgf6Q99NA9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Pcgf6Q99NA9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Pcgf6Q99NA9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pcgf6Q99NA9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pcgf6Q99NA9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pcgf6Q99NA9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pcgf6Q99NA9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Pcgf6Q99NA9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pcgf6Q99NA9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pcgf6Q99NA9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pcgf6Q99NA9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pcgf6Q99NA9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pcgf6Q99NA9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pcgf6Q99NA9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Pcgf6Q99NA9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pcgf6Q99NA9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pcgf6Q99NA9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pcgf6Q99NA9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pcgf6Q99NA9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Pcgf6Q99NA9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Pcgf6Q99NA9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Pcgf6Q99NA9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pcgf6Q99NA9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pcgf6Q99NA9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pcgf6Q99NA9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pcgf6Q99NA9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pcgf6Q99NA9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms