Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brms1Q99N20 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brms1Q99N20 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brms1Q99N20 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brms1Q99N20 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brms1Q99N20 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brms1Q99N20 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brms1Q99N20 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brms1Q99N20 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brms1Q99N20 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brms1Q99N20 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brms1Q99N20 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brms1Q99N20 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brms1Q99N20 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brms1Q99N20 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brms1Q99N20 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brms1Q99N20 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brms1Q99N20 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brms1Q99N20 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brms1Q99N20 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brms1Q99N20 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brms1Q99N20 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brms1Q99N20 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brms1Q99N20 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brms1Q99N20 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brms1Q99N20 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brms1Q99N20 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Brms1Q99N20 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brms1Q99N20 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brms1Q99N20 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brms1Q99N20 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brms1Q99N20 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brms1Q99N20 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Brms1Q99N20 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brms1Q99N20 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brms1Q99N20 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brms1Q99N20 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brms1Q99N20 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brms1Q99N20 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brms1Q99N20 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brms1Q99N20 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brms1Q99N20 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brms1Q99N20 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brms1Q99N20 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brms1Q99N20 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brms1Q99N20 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Brms1Q99N20 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brms1Q99N20 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brms1Q99N20 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brms1Q99N20 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Brms1Q99N20 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Brms1Q99N20 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brms1Q99N20 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brms1Q99N20 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Brms1Q99N20 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Brms1Q99N20 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Brms1Q99N20 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Brms1Q99N20 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brms1Q99N20 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brms1Q99N20 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brms1Q99N20 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brms1Q99N20 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brms1Q99N20 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brms1Q99N20 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brms1Q99N20 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Brms1Q99N20 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brms1Q99N20 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Brms1Q99N20 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brms1Q99N20 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brms1Q99N20 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brms1Q99N20 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brms1Q99N20 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brms1Q99N20 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brms1Q99N20 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brms1Q99N20 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Brms1Q99N20 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brms1Q99N20 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Brms1Q99N20 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Brms1Q99N20 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brms1Q99N20 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms