Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SncaipQ99ME3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SncaipQ99ME3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SncaipQ99ME3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SncaipQ99ME3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SncaipQ99ME3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SncaipQ99ME3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SncaipQ99ME3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SncaipQ99ME3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SncaipQ99ME3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SncaipQ99ME3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SncaipQ99ME3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SncaipQ99ME3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SncaipQ99ME3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SncaipQ99ME3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SncaipQ99ME3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SncaipQ99ME3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SncaipQ99ME3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SncaipQ99ME3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SncaipQ99ME3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SncaipQ99ME3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SncaipQ99ME3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SncaipQ99ME3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SncaipQ99ME3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SncaipQ99ME3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SncaipQ99ME3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SncaipQ99ME3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SncaipQ99ME3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SncaipQ99ME3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SncaipQ99ME3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SncaipQ99ME3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SncaipQ99ME3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SncaipQ99ME3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SncaipQ99ME3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SncaipQ99ME3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SncaipQ99ME3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SncaipQ99ME3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SncaipQ99ME3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SncaipQ99ME3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SncaipQ99ME3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SncaipQ99ME3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SncaipQ99ME3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SncaipQ99ME3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SncaipQ99ME3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SncaipQ99ME3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SncaipQ99ME3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SncaipQ99ME3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SncaipQ99ME3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SncaipQ99ME3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SncaipQ99ME3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SncaipQ99ME3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SncaipQ99ME3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SncaipQ99ME3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SncaipQ99ME3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SncaipQ99ME3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SncaipQ99ME3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SncaipQ99ME3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SncaipQ99ME3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SncaipQ99ME3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SncaipQ99ME3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SncaipQ99ME3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SncaipQ99ME3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SncaipQ99ME3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SncaipQ99ME3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SncaipQ99ME3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SncaipQ99ME3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SncaipQ99ME3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SncaipQ99ME3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SncaipQ99ME3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SncaipQ99ME3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SncaipQ99ME3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms