Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms