Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tm2d1Q99MB3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tm2d1Q99MB3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tm2d1Q99MB3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm2d1Q99MB3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm2d1Q99MB3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms