Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PtprtQ99M80 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PtprtQ99M80 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PtprtQ99M80 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
PtprtQ99M80 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
PtprtQ99M80 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PtprtQ99M80 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
PtprtQ99M80 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
PtprtQ99M80 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PtprtQ99M80 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PtprtQ99M80 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
PtprtQ99M80 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PtprtQ99M80 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PtprtQ99M80 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PtprtQ99M80 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PtprtQ99M80 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
PtprtQ99M80 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PtprtQ99M80 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PtprtQ99M80 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PtprtQ99M80 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PtprtQ99M80 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PtprtQ99M80 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PtprtQ99M80 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PtprtQ99M80 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PtprtQ99M80 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PtprtQ99M80 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PtprtQ99M80 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
PtprtQ99M80 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
PtprtQ99M80 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PtprtQ99M80 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PtprtQ99M80 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PtprtQ99M80 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PtprtQ99M80 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
PtprtQ99M80 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PtprtQ99M80 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PtprtQ99M80 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PtprtQ99M80 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PtprtQ99M80 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PtprtQ99M80 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PtprtQ99M80 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PtprtQ99M80 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PtprtQ99M80 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PtprtQ99M80 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PtprtQ99M80 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PtprtQ99M80 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PtprtQ99M80 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PtprtQ99M80 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PtprtQ99M80 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PtprtQ99M80 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PtprtQ99M80 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PtprtQ99M80 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PtprtQ99M80 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PtprtQ99M80 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PtprtQ99M80 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PtprtQ99M80 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PtprtQ99M80 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PtprtQ99M80 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PtprtQ99M80 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PtprtQ99M80 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PtprtQ99M80 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PtprtQ99M80 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PtprtQ99M80 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
PtprtQ99M80 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PtprtQ99M80 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
PtprtQ99M80 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PtprtQ99M80 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PtprtQ99M80 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PtprtQ99M80 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PtprtQ99M80 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PtprtQ99M80 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PtprtQ99M80 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PtprtQ99M80 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PtprtQ99M80 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
PtprtQ99M80 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
PtprtQ99M80 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PtprtQ99M80 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PtprtQ99M80 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
PtprtQ99M80 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
PtprtQ99M80 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PtprtQ99M80 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PtprtQ99M80 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PtprtQ99M80 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
PtprtQ99M80 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PtprtQ99M80 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PtprtQ99M80 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PtprtQ99M80 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
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