Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cstf3Q99LI7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cstf3Q99LI7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cstf3Q99LI7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cstf3Q99LI7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cstf3Q99LI7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cstf3Q99LI7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cstf3Q99LI7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cstf3Q99LI7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cstf3Q99LI7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cstf3Q99LI7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cstf3Q99LI7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cstf3Q99LI7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cstf3Q99LI7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cstf3Q99LI7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cstf3Q99LI7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cstf3Q99LI7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cstf3Q99LI7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cstf3Q99LI7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cstf3Q99LI7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cstf3Q99LI7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cstf3Q99LI7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cstf3Q99LI7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cstf3Q99LI7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cstf3Q99LI7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cstf3Q99LI7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cstf3Q99LI7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cstf3Q99LI7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cstf3Q99LI7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cstf3Q99LI7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cstf3Q99LI7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cstf3Q99LI7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cstf3Q99LI7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cstf3Q99LI7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cstf3Q99LI7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cstf3Q99LI7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cstf3Q99LI7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cstf3Q99LI7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cstf3Q99LI7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cstf3Q99LI7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cstf3Q99LI7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cstf3Q99LI7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cstf3Q99LI7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cstf3Q99LI7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cstf3Q99LI7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms