Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TriobpQ99KW3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TriobpQ99KW3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TriobpQ99KW3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TriobpQ99KW3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TriobpQ99KW3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TriobpQ99KW3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TriobpQ99KW3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TriobpQ99KW3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TriobpQ99KW3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TriobpQ99KW3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TriobpQ99KW3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TriobpQ99KW3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TriobpQ99KW3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TriobpQ99KW3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TriobpQ99KW3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TriobpQ99KW3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TriobpQ99KW3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TriobpQ99KW3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TriobpQ99KW3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TriobpQ99KW3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TriobpQ99KW3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TriobpQ99KW3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TriobpQ99KW3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TriobpQ99KW3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TriobpQ99KW3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TriobpQ99KW3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TriobpQ99KW3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TriobpQ99KW3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TriobpQ99KW3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TriobpQ99KW3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TriobpQ99KW3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TriobpQ99KW3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TriobpQ99KW3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TriobpQ99KW3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TriobpQ99KW3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TriobpQ99KW3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TriobpQ99KW3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TriobpQ99KW3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TriobpQ99KW3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TriobpQ99KW3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TriobpQ99KW3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TriobpQ99KW3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TriobpQ99KW3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TriobpQ99KW3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TriobpQ99KW3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TriobpQ99KW3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TriobpQ99KW3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TriobpQ99KW3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TriobpQ99KW3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TriobpQ99KW3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TriobpQ99KW3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TriobpQ99KW3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TriobpQ99KW3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TriobpQ99KW3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TriobpQ99KW3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TriobpQ99KW3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TriobpQ99KW3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TriobpQ99KW3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TriobpQ99KW3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TriobpQ99KW3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TriobpQ99KW3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TriobpQ99KW3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TriobpQ99KW3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TriobpQ99KW3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TriobpQ99KW3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TriobpQ99KW3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TriobpQ99KW3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TriobpQ99KW3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TriobpQ99KW3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TriobpQ99KW3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TriobpQ99KW3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TriobpQ99KW3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TriobpQ99KW3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TriobpQ99KW3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TriobpQ99KW3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TriobpQ99KW3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms