Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubxn2aQ99KJ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ubxn2aQ99KJ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ubxn2aQ99KJ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ubxn2aQ99KJ0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ubxn2aQ99KJ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ubxn2aQ99KJ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubxn2aQ99KJ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ubxn2aQ99KJ0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms