Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NelfcdQ922L6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NelfcdQ922L6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NelfcdQ922L6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NelfcdQ922L6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NelfcdQ922L6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NelfcdQ922L6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NelfcdQ922L6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NelfcdQ922L6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NelfcdQ922L6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NelfcdQ922L6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NelfcdQ922L6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NelfcdQ922L6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NelfcdQ922L6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NelfcdQ922L6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NelfcdQ922L6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NelfcdQ922L6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NelfcdQ922L6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NelfcdQ922L6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NelfcdQ922L6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NelfcdQ922L6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NelfcdQ922L6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NelfcdQ922L6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NelfcdQ922L6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NelfcdQ922L6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NelfcdQ922L6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NelfcdQ922L6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NelfcdQ922L6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NelfcdQ922L6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NelfcdQ922L6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NelfcdQ922L6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NelfcdQ922L6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NelfcdQ922L6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NelfcdQ922L6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NelfcdQ922L6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NelfcdQ922L6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NelfcdQ922L6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NelfcdQ922L6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NelfcdQ922L6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NelfcdQ922L6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NelfcdQ922L6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NelfcdQ922L6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NelfcdQ922L6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NelfcdQ922L6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NelfcdQ922L6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NelfcdQ922L6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms