Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Slc5a4bQ91ZP4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Slc5a4bQ91ZP4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Slc5a4bQ91ZP4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Slc5a4bQ91ZP4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Slc5a4bQ91ZP4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Slc5a4bQ91ZP4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Slc5a4bQ91ZP4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Slc5a4bQ91ZP4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Slc5a4bQ91ZP4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Slc5a4bQ91ZP4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Slc5a4bQ91ZP4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Slc5a4bQ91ZP4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Slc5a4bQ91ZP4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Slc5a4bQ91ZP4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Slc5a4bQ91ZP4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Slc5a4bQ91ZP4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Slc5a4bQ91ZP4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Slc5a4bQ91ZP4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Slc5a4bQ91ZP4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Slc5a4bQ91ZP4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Slc5a4bQ91ZP4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Slc5a4bQ91ZP4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Slc5a4bQ91ZP4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Slc5a4bQ91ZP4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Slc5a4bQ91ZP4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Slc5a4bQ91ZP4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Slc5a4bQ91ZP4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Slc5a4bQ91ZP4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Slc5a4bQ91ZP4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Slc5a4bQ91ZP4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Slc5a4bQ91ZP4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slc5a4bQ91ZP4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slc5a4bQ91ZP4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slc5a4bQ91ZP4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slc5a4bQ91ZP4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Slc5a4bQ91ZP4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Slc5a4bQ91ZP4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Slc5a4bQ91ZP4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Slc5a4bQ91ZP4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Slc5a4bQ91ZP4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Slc5a4bQ91ZP4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Slc5a4bQ91ZP4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Slc5a4bQ91ZP4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Slc5a4bQ91ZP4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Slc5a4bQ91ZP4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Slc5a4bQ91ZP4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Slc5a4bQ91ZP4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Slc5a4bQ91ZP4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slc5a4bQ91ZP4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slc5a4bQ91ZP4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slc5a4bQ91ZP4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slc5a4bQ91ZP4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Slc5a4bQ91ZP4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Slc5a4bQ91ZP4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Slc5a4bQ91ZP4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Slc5a4bQ91ZP4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Slc5a4bQ91ZP4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Slc5a4bQ91ZP4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Slc5a4bQ91ZP4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Slc5a4bQ91ZP4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Slc5a4bQ91ZP4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Slc5a4bQ91ZP4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Slc5a4bQ91ZP4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Slc5a4bQ91ZP4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Slc5a4bQ91ZP4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Slc5a4bQ91ZP4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Slc5a4bQ91ZP4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Slc5a4bQ91ZP4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Slc5a4bQ91ZP4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Slc5a4bQ91ZP4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Slc5a4bQ91ZP4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Slc5a4bQ91ZP4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Slc5a4bQ91ZP4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Slc5a4bQ91ZP4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Slc5a4bQ91ZP4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Slc5a4bQ91ZP4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Slc5a4bQ91ZP4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Slc5a4bQ91ZP4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Slc5a4bQ91ZP4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Slc5a4bQ91ZP4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Slc5a4bQ91ZP4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Slc5a4bQ91ZP4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms