Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZM2

Sh2b1, SH2B adapter protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b1Q91ZM2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh2b1Q91ZM2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh2b1Q91ZM2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh2b1Q91ZM2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sh2b1Q91ZM2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sh2b1Q91ZM2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh2b1Q91ZM2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh2b1Q91ZM2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sh2b1Q91ZM2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh2b1Q91ZM2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh2b1Q91ZM2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sh2b1Q91ZM2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh2b1Q91ZM2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh2b1Q91ZM2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh2b1Q91ZM2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh2b1Q91ZM2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sh2b1Q91ZM2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sh2b1Q91ZM2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sh2b1Q91ZM2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh2b1Q91ZM2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh2b1Q91ZM2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh2b1Q91ZM2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh2b1Q91ZM2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh2b1Q91ZM2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh2b1Q91ZM2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh2b1Q91ZM2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh2b1Q91ZM2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh2b1Q91ZM2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh2b1Q91ZM2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh2b1Q91ZM2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh2b1Q91ZM2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh2b1Q91ZM2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh2b1Q91ZM2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh2b1Q91ZM2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh2b1Q91ZM2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms