Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc49Q91YK0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc49Q91YK0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc49Q91YK0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc49Q91YK0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc49Q91YK0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc49Q91YK0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms