Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcdha12Q91Y18 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcdha12Q91Y18 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcdha12Q91Y18 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcdha12Q91Y18 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcdha12Q91Y18 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcdha12Q91Y18 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcdha12Q91Y18 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcdha12Q91Y18 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcdha12Q91Y18 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcdha12Q91Y18 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcdha12Q91Y18 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcdha12Q91Y18 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcdha12Q91Y18 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcdha12Q91Y18 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcdha12Q91Y18 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcdha12Q91Y18 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcdha12Q91Y18 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcdha12Q91Y18 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcdha12Q91Y18 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcdha12Q91Y18 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcdha12Q91Y18 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcdha12Q91Y18 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcdha12Q91Y18 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcdha12Q91Y18 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcdha12Q91Y18 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcdha12Q91Y18 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcdha12Q91Y18 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcdha12Q91Y18 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcdha12Q91Y18 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pcdha12Q91Y18 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcdha12Q91Y18 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcdha12Q91Y18 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcdha12Q91Y18 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcdha12Q91Y18 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcdha12Q91Y18 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pcdha12Q91Y18 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcdha12Q91Y18 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pcdha12Q91Y18 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcdha12Q91Y18 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcdha12Q91Y18 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcdha12Q91Y18 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcdha12Q91Y18 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcdha12Q91Y18 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcdha12Q91Y18 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcdha12Q91Y18 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcdha12Q91Y18 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcdha12Q91Y18 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcdha12Q91Y18 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcdha12Q91Y18 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcdha12Q91Y18 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcdha12Q91Y18 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcdha12Q91Y18 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Pcdha12Q91Y18 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms