Protein–RNA interactions for Protein: Q91X46

Arhgef3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef3Q91X46 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgef3Q91X46 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgef3Q91X46 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef3Q91X46 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef3Q91X46 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgef3Q91X46 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arhgef3Q91X46 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arhgef3Q91X46 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arhgef3Q91X46 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arhgef3Q91X46 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arhgef3Q91X46 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arhgef3Q91X46 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arhgef3Q91X46 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arhgef3Q91X46 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arhgef3Q91X46 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arhgef3Q91X46 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arhgef3Q91X46 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arhgef3Q91X46 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arhgef3Q91X46 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arhgef3Q91X46 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arhgef3Q91X46 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgef3Q91X46 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arhgef3Q91X46 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgef3Q91X46 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgef3Q91X46 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgef3Q91X46 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgef3Q91X46 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Arhgef3Q91X46 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arhgef3Q91X46 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arhgef3Q91X46 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgef3Q91X46 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgef3Q91X46 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgef3Q91X46 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgef3Q91X46 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgef3Q91X46 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arhgef3Q91X46 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arhgef3Q91X46 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arhgef3Q91X46 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgef3Q91X46 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgef3Q91X46 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgef3Q91X46 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgef3Q91X46 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgef3Q91X46 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Arhgef3Q91X46 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arhgef3Q91X46 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgef3Q91X46 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgef3Q91X46 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgef3Q91X46 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgef3Q91X46 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgef3Q91X46 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgef3Q91X46 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgef3Q91X46 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgef3Q91X46 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgef3Q91X46 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgef3Q91X46 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arhgef3Q91X46 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgef3Q91X46 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgef3Q91X46 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgef3Q91X46 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgef3Q91X46 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgef3Q91X46 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgef3Q91X46 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgef3Q91X46 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgef3Q91X46 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgef3Q91X46 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgef3Q91X46 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgef3Q91X46 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgef3Q91X46 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgef3Q91X46 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgef3Q91X46 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgef3Q91X46 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgef3Q91X46 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgef3Q91X46 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgef3Q91X46 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgef3Q91X46 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgef3Q91X46 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgef3Q91X46 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgef3Q91X46 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms