Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nlrp6Q91WS2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Nlrp6Q91WS2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Nlrp6Q91WS2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Nlrp6Q91WS2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nlrp6Q91WS2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nlrp6Q91WS2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nlrp6Q91WS2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nlrp6Q91WS2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Nlrp6Q91WS2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nlrp6Q91WS2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nlrp6Q91WS2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nlrp6Q91WS2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Nlrp6Q91WS2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Nlrp6Q91WS2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nlrp6Q91WS2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nlrp6Q91WS2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nlrp6Q91WS2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nlrp6Q91WS2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nlrp6Q91WS2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Nlrp6Q91WS2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Nlrp6Q91WS2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Nlrp6Q91WS2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nlrp6Q91WS2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Nlrp6Q91WS2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nlrp6Q91WS2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nlrp6Q91WS2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nlrp6Q91WS2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Nlrp6Q91WS2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nlrp6Q91WS2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nlrp6Q91WS2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nlrp6Q91WS2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nlrp6Q91WS2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nlrp6Q91WS2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Nlrp6Q91WS2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nlrp6Q91WS2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Nlrp6Q91WS2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nlrp6Q91WS2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Nlrp6Q91WS2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nlrp6Q91WS2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nlrp6Q91WS2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nlrp6Q91WS2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nlrp6Q91WS2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nlrp6Q91WS2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nlrp6Q91WS2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nlrp6Q91WS2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nlrp6Q91WS2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Nlrp6Q91WS2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nlrp6Q91WS2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nlrp6Q91WS2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nlrp6Q91WS2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nlrp6Q91WS2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nlrp6Q91WS2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nlrp6Q91WS2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Nlrp6Q91WS2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Nlrp6Q91WS2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nlrp6Q91WS2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nlrp6Q91WS2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nlrp6Q91WS2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Nlrp6Q91WS2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nlrp6Q91WS2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nlrp6Q91WS2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nlrp6Q91WS2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nlrp6Q91WS2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Nlrp6Q91WS2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nlrp6Q91WS2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nlrp6Q91WS2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nlrp6Q91WS2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms