Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT1

Txlnb, Beta-taxilin, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnbQ8VBT1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TxlnbQ8VBT1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TxlnbQ8VBT1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TxlnbQ8VBT1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TxlnbQ8VBT1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TxlnbQ8VBT1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TxlnbQ8VBT1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TxlnbQ8VBT1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TxlnbQ8VBT1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TxlnbQ8VBT1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TxlnbQ8VBT1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TxlnbQ8VBT1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TxlnbQ8VBT1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TxlnbQ8VBT1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TxlnbQ8VBT1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TxlnbQ8VBT1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TxlnbQ8VBT1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TxlnbQ8VBT1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TxlnbQ8VBT1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TxlnbQ8VBT1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TxlnbQ8VBT1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TxlnbQ8VBT1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TxlnbQ8VBT1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TxlnbQ8VBT1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TxlnbQ8VBT1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TxlnbQ8VBT1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TxlnbQ8VBT1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TxlnbQ8VBT1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TxlnbQ8VBT1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TxlnbQ8VBT1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TxlnbQ8VBT1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TxlnbQ8VBT1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TxlnbQ8VBT1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TxlnbQ8VBT1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TxlnbQ8VBT1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TxlnbQ8VBT1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TxlnbQ8VBT1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TxlnbQ8VBT1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TxlnbQ8VBT1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TxlnbQ8VBT1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TxlnbQ8VBT1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TxlnbQ8VBT1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TxlnbQ8VBT1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TxlnbQ8VBT1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TxlnbQ8VBT1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TxlnbQ8VBT1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TxlnbQ8VBT1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TxlnbQ8VBT1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TxlnbQ8VBT1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TxlnbQ8VBT1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TxlnbQ8VBT1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TxlnbQ8VBT1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TxlnbQ8VBT1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TxlnbQ8VBT1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TxlnbQ8VBT1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TxlnbQ8VBT1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TxlnbQ8VBT1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TxlnbQ8VBT1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TxlnbQ8VBT1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TxlnbQ8VBT1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TxlnbQ8VBT1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TxlnbQ8VBT1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TxlnbQ8VBT1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms