Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpsap2Q8R574 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpsap2Q8R574 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpsap2Q8R574 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpsap2Q8R574 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpsap2Q8R574 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpsap2Q8R574 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpsap2Q8R574 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpsap2Q8R574 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpsap2Q8R574 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpsap2Q8R574 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpsap2Q8R574 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpsap2Q8R574 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpsap2Q8R574 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpsap2Q8R574 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpsap2Q8R574 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpsap2Q8R574 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpsap2Q8R574 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpsap2Q8R574 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpsap2Q8R574 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpsap2Q8R574 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpsap2Q8R574 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpsap2Q8R574 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpsap2Q8R574 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpsap2Q8R574 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpsap2Q8R574 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpsap2Q8R574 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpsap2Q8R574 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpsap2Q8R574 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prpsap2Q8R574 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpsap2Q8R574 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpsap2Q8R574 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpsap2Q8R574 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpsap2Q8R574 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpsap2Q8R574 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpsap2Q8R574 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpsap2Q8R574 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpsap2Q8R574 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpsap2Q8R574 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpsap2Q8R574 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpsap2Q8R574 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpsap2Q8R574 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prpsap2Q8R574 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpsap2Q8R574 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpsap2Q8R574 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpsap2Q8R574 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpsap2Q8R574 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpsap2Q8R574 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpsap2Q8R574 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpsap2Q8R574 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpsap2Q8R574 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpsap2Q8R574 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpsap2Q8R574 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpsap2Q8R574 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpsap2Q8R574 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpsap2Q8R574 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpsap2Q8R574 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpsap2Q8R574 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpsap2Q8R574 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpsap2Q8R574 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpsap2Q8R574 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpsap2Q8R574 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpsap2Q8R574 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpsap2Q8R574 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpsap2Q8R574 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpsap2Q8R574 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpsap2Q8R574 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms