Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mterf3Q8R3J4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mterf3Q8R3J4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mterf3Q8R3J4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mterf3Q8R3J4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mterf3Q8R3J4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mterf3Q8R3J4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mterf3Q8R3J4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mterf3Q8R3J4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mterf3Q8R3J4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mterf3Q8R3J4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mterf3Q8R3J4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mterf3Q8R3J4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mterf3Q8R3J4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mterf3Q8R3J4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mterf3Q8R3J4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mterf3Q8R3J4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mterf3Q8R3J4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mterf3Q8R3J4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mterf3Q8R3J4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mterf3Q8R3J4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mterf3Q8R3J4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mterf3Q8R3J4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mterf3Q8R3J4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mterf3Q8R3J4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mterf3Q8R3J4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mterf3Q8R3J4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mterf3Q8R3J4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mterf3Q8R3J4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mterf3Q8R3J4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mterf3Q8R3J4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mterf3Q8R3J4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mterf3Q8R3J4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mterf3Q8R3J4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mterf3Q8R3J4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mterf3Q8R3J4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mterf3Q8R3J4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mterf3Q8R3J4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mterf3Q8R3J4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mterf3Q8R3J4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mterf3Q8R3J4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mterf3Q8R3J4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms