Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim29Q8R2Q0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim29Q8R2Q0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim29Q8R2Q0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim29Q8R2Q0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim29Q8R2Q0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim29Q8R2Q0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim29Q8R2Q0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim29Q8R2Q0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim29Q8R2Q0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim29Q8R2Q0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim29Q8R2Q0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim29Q8R2Q0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim29Q8R2Q0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trim29Q8R2Q0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim29Q8R2Q0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim29Q8R2Q0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim29Q8R2Q0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim29Q8R2Q0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim29Q8R2Q0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim29Q8R2Q0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim29Q8R2Q0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim29Q8R2Q0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Trim29Q8R2Q0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim29Q8R2Q0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trim29Q8R2Q0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim29Q8R2Q0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim29Q8R2Q0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Trim29Q8R2Q0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim29Q8R2Q0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim29Q8R2Q0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim29Q8R2Q0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim29Q8R2Q0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim29Q8R2Q0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim29Q8R2Q0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim29Q8R2Q0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim29Q8R2Q0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim29Q8R2Q0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim29Q8R2Q0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim29Q8R2Q0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim29Q8R2Q0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim29Q8R2Q0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim29Q8R2Q0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim29Q8R2Q0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim29Q8R2Q0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim29Q8R2Q0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim29Q8R2Q0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim29Q8R2Q0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim29Q8R2Q0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim29Q8R2Q0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim29Q8R2Q0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim29Q8R2Q0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim29Q8R2Q0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim29Q8R2Q0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim29Q8R2Q0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim29Q8R2Q0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim29Q8R2Q0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim29Q8R2Q0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim29Q8R2Q0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim29Q8R2Q0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim29Q8R2Q0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim29Q8R2Q0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim29Q8R2Q0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim29Q8R2Q0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim29Q8R2Q0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim29Q8R2Q0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim29Q8R2Q0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim29Q8R2Q0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim29Q8R2Q0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim29Q8R2Q0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim29Q8R2Q0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim29Q8R2Q0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim29Q8R2Q0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim29Q8R2Q0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim29Q8R2Q0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim29Q8R2Q0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim29Q8R2Q0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim29Q8R2Q0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim29Q8R2Q0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim29Q8R2Q0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim29Q8R2Q0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim29Q8R2Q0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms