Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r212Q8R268 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r212Q8R268 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r212Q8R268 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r212Q8R268 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r212Q8R268 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r212Q8R268 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r212Q8R268 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r212Q8R268 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r212Q8R268 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r212Q8R268 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r212Q8R268 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r212Q8R268 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r212Q8R268 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r212Q8R268 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r212Q8R268 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r212Q8R268 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r212Q8R268 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r212Q8R268 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r212Q8R268 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r212Q8R268 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r212Q8R268 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r212Q8R268 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r212Q8R268 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r212Q8R268 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r212Q8R268 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms