Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps37bQ8R0J7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps37bQ8R0J7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps37bQ8R0J7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps37bQ8R0J7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps37bQ8R0J7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps37bQ8R0J7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps37bQ8R0J7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps37bQ8R0J7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps37bQ8R0J7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps37bQ8R0J7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps37bQ8R0J7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps37bQ8R0J7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps37bQ8R0J7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps37bQ8R0J7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps37bQ8R0J7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps37bQ8R0J7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps37bQ8R0J7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps37bQ8R0J7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps37bQ8R0J7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps37bQ8R0J7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps37bQ8R0J7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps37bQ8R0J7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps37bQ8R0J7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps37bQ8R0J7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps37bQ8R0J7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps37bQ8R0J7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps37bQ8R0J7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps37bQ8R0J7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps37bQ8R0J7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps37bQ8R0J7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps37bQ8R0J7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps37bQ8R0J7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps37bQ8R0J7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps37bQ8R0J7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps37bQ8R0J7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps37bQ8R0J7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps37bQ8R0J7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps37bQ8R0J7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps37bQ8R0J7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps37bQ8R0J7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps37bQ8R0J7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps37bQ8R0J7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps37bQ8R0J7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps37bQ8R0J7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps37bQ8R0J7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps37bQ8R0J7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps37bQ8R0J7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps37bQ8R0J7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms