Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J2

Ebf4, Transcription factor COE4, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf4Q8K4J2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ebf4Q8K4J2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ebf4Q8K4J2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ebf4Q8K4J2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ebf4Q8K4J2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ebf4Q8K4J2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ebf4Q8K4J2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ebf4Q8K4J2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ebf4Q8K4J2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ebf4Q8K4J2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ebf4Q8K4J2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ebf4Q8K4J2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ebf4Q8K4J2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ebf4Q8K4J2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ebf4Q8K4J2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ebf4Q8K4J2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ebf4Q8K4J2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ebf4Q8K4J2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ebf4Q8K4J2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ebf4Q8K4J2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ebf4Q8K4J2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ebf4Q8K4J2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ebf4Q8K4J2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ebf4Q8K4J2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ebf4Q8K4J2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf4Q8K4J2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf4Q8K4J2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf4Q8K4J2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf4Q8K4J2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf4Q8K4J2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf4Q8K4J2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ebf4Q8K4J2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ebf4Q8K4J2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ebf4Q8K4J2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ebf4Q8K4J2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ebf4Q8K4J2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ebf4Q8K4J2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ebf4Q8K4J2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ebf4Q8K4J2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ebf4Q8K4J2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ebf4Q8K4J2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ebf4Q8K4J2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ebf4Q8K4J2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ebf4Q8K4J2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms