Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssh3Q8K330 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssh3Q8K330 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssh3Q8K330 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssh3Q8K330 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssh3Q8K330 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssh3Q8K330 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssh3Q8K330 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssh3Q8K330 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssh3Q8K330 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssh3Q8K330 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssh3Q8K330 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssh3Q8K330 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssh3Q8K330 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssh3Q8K330 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssh3Q8K330 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssh3Q8K330 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssh3Q8K330 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssh3Q8K330 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssh3Q8K330 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssh3Q8K330 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssh3Q8K330 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssh3Q8K330 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ssh3Q8K330 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ssh3Q8K330 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssh3Q8K330 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssh3Q8K330 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssh3Q8K330 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssh3Q8K330 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssh3Q8K330 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssh3Q8K330 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssh3Q8K330 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ssh3Q8K330 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh3Q8K330 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssh3Q8K330 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssh3Q8K330 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssh3Q8K330 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssh3Q8K330 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms