Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Shtn1Q8K2Q9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Shtn1Q8K2Q9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Shtn1Q8K2Q9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Shtn1Q8K2Q9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Shtn1Q8K2Q9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Shtn1Q8K2Q9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Shtn1Q8K2Q9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Shtn1Q8K2Q9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Shtn1Q8K2Q9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Shtn1Q8K2Q9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Shtn1Q8K2Q9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Shtn1Q8K2Q9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Shtn1Q8K2Q9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Shtn1Q8K2Q9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Shtn1Q8K2Q9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Shtn1Q8K2Q9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Shtn1Q8K2Q9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Shtn1Q8K2Q9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Shtn1Q8K2Q9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Shtn1Q8K2Q9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Shtn1Q8K2Q9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Shtn1Q8K2Q9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Shtn1Q8K2Q9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Shtn1Q8K2Q9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shtn1Q8K2Q9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Shtn1Q8K2Q9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Shtn1Q8K2Q9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Shtn1Q8K2Q9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Shtn1Q8K2Q9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shtn1Q8K2Q9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shtn1Q8K2Q9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Shtn1Q8K2Q9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Shtn1Q8K2Q9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Shtn1Q8K2Q9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shtn1Q8K2Q9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Shtn1Q8K2Q9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Shtn1Q8K2Q9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Shtn1Q8K2Q9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Shtn1Q8K2Q9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shtn1Q8K2Q9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Shtn1Q8K2Q9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Shtn1Q8K2Q9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shtn1Q8K2Q9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Shtn1Q8K2Q9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shtn1Q8K2Q9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shtn1Q8K2Q9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Shtn1Q8K2Q9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shtn1Q8K2Q9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shtn1Q8K2Q9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shtn1Q8K2Q9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shtn1Q8K2Q9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shtn1Q8K2Q9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shtn1Q8K2Q9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Shtn1Q8K2Q9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shtn1Q8K2Q9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shtn1Q8K2Q9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shtn1Q8K2Q9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Shtn1Q8K2Q9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Shtn1Q8K2Q9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Shtn1Q8K2Q9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Shtn1Q8K2Q9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Shtn1Q8K2Q9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Shtn1Q8K2Q9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Shtn1Q8K2Q9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Shtn1Q8K2Q9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Shtn1Q8K2Q9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Shtn1Q8K2Q9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Shtn1Q8K2Q9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Shtn1Q8K2Q9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms