Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trappc12Q8K2L8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trappc12Q8K2L8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trappc12Q8K2L8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trappc12Q8K2L8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trappc12Q8K2L8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trappc12Q8K2L8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trappc12Q8K2L8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trappc12Q8K2L8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trappc12Q8K2L8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trappc12Q8K2L8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Trappc12Q8K2L8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trappc12Q8K2L8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trappc12Q8K2L8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trappc12Q8K2L8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trappc12Q8K2L8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trappc12Q8K2L8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trappc12Q8K2L8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trappc12Q8K2L8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trappc12Q8K2L8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trappc12Q8K2L8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trappc12Q8K2L8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trappc12Q8K2L8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trappc12Q8K2L8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trappc12Q8K2L8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trappc12Q8K2L8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trappc12Q8K2L8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trappc12Q8K2L8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trappc12Q8K2L8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trappc12Q8K2L8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Trappc12Q8K2L8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trappc12Q8K2L8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trappc12Q8K2L8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trappc12Q8K2L8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trappc12Q8K2L8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trappc12Q8K2L8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Trappc12Q8K2L8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trappc12Q8K2L8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trappc12Q8K2L8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trappc12Q8K2L8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trappc12Q8K2L8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trappc12Q8K2L8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trappc12Q8K2L8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trappc12Q8K2L8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trappc12Q8K2L8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trappc12Q8K2L8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Trappc12Q8K2L8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trappc12Q8K2L8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trappc12Q8K2L8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trappc12Q8K2L8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trappc12Q8K2L8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trappc12Q8K2L8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trappc12Q8K2L8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trappc12Q8K2L8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trappc12Q8K2L8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trappc12Q8K2L8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trappc12Q8K2L8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trappc12Q8K2L8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trappc12Q8K2L8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trappc12Q8K2L8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trappc12Q8K2L8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trappc12Q8K2L8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trappc12Q8K2L8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trappc12Q8K2L8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trappc12Q8K2L8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trappc12Q8K2L8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trappc12Q8K2L8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trappc12Q8K2L8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trappc12Q8K2L8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trappc12Q8K2L8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trappc12Q8K2L8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trappc12Q8K2L8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trappc12Q8K2L8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trappc12Q8K2L8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trappc12Q8K2L8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trappc12Q8K2L8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trappc12Q8K2L8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Trappc12Q8K2L8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Trappc12Q8K2L8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trappc12Q8K2L8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trappc12Q8K2L8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trappc12Q8K2L8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trappc12Q8K2L8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trappc12Q8K2L8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms