Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Neurl3Q8CJC5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl3Q8CJC5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl3Q8CJC5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl3Q8CJC5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl3Q8CJC5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Neurl3Q8CJC5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurl3Q8CJC5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurl3Q8CJC5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurl3Q8CJC5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl3Q8CJC5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl3Q8CJC5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl3Q8CJC5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl3Q8CJC5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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Neurl3Q8CJC5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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Neurl3Q8CJC5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurl3Q8CJC5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurl3Q8CJC5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Neurl3Q8CJC5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurl3Q8CJC5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurl3Q8CJC5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurl3Q8CJC5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurl3Q8CJC5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurl3Q8CJC5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurl3Q8CJC5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurl3Q8CJC5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurl3Q8CJC5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neurl3Q8CJC5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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Neurl3Q8CJC5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
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Neurl3Q8CJC5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurl3Q8CJC5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Neurl3Q8CJC5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurl3Q8CJC5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurl3Q8CJC5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Neurl3Q8CJC5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Neurl3Q8CJC5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Neurl3Q8CJC5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Neurl3Q8CJC5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Neurl3Q8CJC5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Neurl3Q8CJC5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Neurl3Q8CJC5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurl3Q8CJC5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurl3Q8CJC5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl3Q8CJC5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl3Q8CJC5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl3Q8CJC5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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Neurl3Q8CJC5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurl3Q8CJC5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl3Q8CJC5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurl3Q8CJC5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurl3Q8CJC5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurl3Q8CJC5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurl3Q8CJC5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Neurl3Q8CJC5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Neurl3Q8CJC5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms