Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip4Q8CI96 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip4Q8CI96 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip4Q8CI96 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clip4Q8CI96 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip4Q8CI96 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip4Q8CI96 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clip4Q8CI96 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clip4Q8CI96 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip4Q8CI96 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clip4Q8CI96 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip4Q8CI96 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip4Q8CI96 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip4Q8CI96 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clip4Q8CI96 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip4Q8CI96 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clip4Q8CI96 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clip4Q8CI96 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip4Q8CI96 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clip4Q8CI96 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clip4Q8CI96 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clip4Q8CI96 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clip4Q8CI96 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip4Q8CI96 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip4Q8CI96 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip4Q8CI96 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip4Q8CI96 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip4Q8CI96 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip4Q8CI96 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip4Q8CI96 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip4Q8CI96 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip4Q8CI96 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip4Q8CI96 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip4Q8CI96 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip4Q8CI96 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip4Q8CI96 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip4Q8CI96 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip4Q8CI96 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip4Q8CI96 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms