Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csnka2ipQ8CH19 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csnka2ipQ8CH19 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csnka2ipQ8CH19 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csnka2ipQ8CH19 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csnka2ipQ8CH19 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csnka2ipQ8CH19 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csnka2ipQ8CH19 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csnka2ipQ8CH19 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csnka2ipQ8CH19 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csnka2ipQ8CH19 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csnka2ipQ8CH19 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csnka2ipQ8CH19 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csnka2ipQ8CH19 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csnka2ipQ8CH19 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csnka2ipQ8CH19 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csnka2ipQ8CH19 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csnka2ipQ8CH19 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csnka2ipQ8CH19 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Csnka2ipQ8CH19 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csnka2ipQ8CH19 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csnka2ipQ8CH19 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csnka2ipQ8CH19 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Csnka2ipQ8CH19 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Csnka2ipQ8CH19 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms