Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ9

4932414N04Rik, RIKEN cDNA 4932414N04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932414N04RikQ8CEQ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4932414N04RikQ8CEQ9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4932414N04RikQ8CEQ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
4932414N04RikQ8CEQ9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4932414N04RikQ8CEQ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4932414N04RikQ8CEQ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4932414N04RikQ8CEQ9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4932414N04RikQ8CEQ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4932414N04RikQ8CEQ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4932414N04RikQ8CEQ9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4932414N04RikQ8CEQ9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4932414N04RikQ8CEQ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4932414N04RikQ8CEQ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4932414N04RikQ8CEQ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4932414N04RikQ8CEQ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4932414N04RikQ8CEQ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4932414N04RikQ8CEQ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4932414N04RikQ8CEQ9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4932414N04RikQ8CEQ9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4932414N04RikQ8CEQ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4932414N04RikQ8CEQ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4932414N04RikQ8CEQ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
4932414N04RikQ8CEQ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4932414N04RikQ8CEQ9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4932414N04RikQ8CEQ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4932414N04RikQ8CEQ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4932414N04RikQ8CEQ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4932414N04RikQ8CEQ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4932414N04RikQ8CEQ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4932414N04RikQ8CEQ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4932414N04RikQ8CEQ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4932414N04RikQ8CEQ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4932414N04RikQ8CEQ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4932414N04RikQ8CEQ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4932414N04RikQ8CEQ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4932414N04RikQ8CEQ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4932414N04RikQ8CEQ9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4932414N04RikQ8CEQ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4932414N04RikQ8CEQ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4932414N04RikQ8CEQ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4932414N04RikQ8CEQ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4932414N04RikQ8CEQ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4932414N04RikQ8CEQ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4932414N04RikQ8CEQ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4932414N04RikQ8CEQ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4932414N04RikQ8CEQ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
4932414N04RikQ8CEQ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms