Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc38Q8CDN8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc38Q8CDN8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc38Q8CDN8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc38Q8CDN8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc38Q8CDN8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc38Q8CDN8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc38Q8CDN8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc38Q8CDN8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc38Q8CDN8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc38Q8CDN8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc38Q8CDN8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc38Q8CDN8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc38Q8CDN8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc38Q8CDN8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc38Q8CDN8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc38Q8CDN8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc38Q8CDN8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc38Q8CDN8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc38Q8CDN8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc38Q8CDN8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc38Q8CDN8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc38Q8CDN8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc38Q8CDN8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc38Q8CDN8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc38Q8CDN8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc38Q8CDN8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc38Q8CDN8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc38Q8CDN8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc38Q8CDN8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc38Q8CDN8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc38Q8CDN8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc38Q8CDN8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc38Q8CDN8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc38Q8CDN8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc38Q8CDN8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc38Q8CDN8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc38Q8CDN8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc38Q8CDN8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc38Q8CDN8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc38Q8CDN8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc38Q8CDN8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc38Q8CDN8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc38Q8CDN8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc38Q8CDN8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc38Q8CDN8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc38Q8CDN8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc38Q8CDN8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc38Q8CDN8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc38Q8CDN8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccdc38Q8CDN8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc38Q8CDN8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc38Q8CDN8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc38Q8CDN8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc38Q8CDN8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc38Q8CDN8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc38Q8CDN8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc38Q8CDN8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc38Q8CDN8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc38Q8CDN8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc38Q8CDN8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc38Q8CDN8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc38Q8CDN8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc38Q8CDN8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc38Q8CDN8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc38Q8CDN8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc38Q8CDN8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc38Q8CDN8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc38Q8CDN8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc38Q8CDN8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc38Q8CDN8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc38Q8CDN8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc38Q8CDN8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc38Q8CDN8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc38Q8CDN8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc38Q8CDN8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc38Q8CDN8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc38Q8CDN8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc38Q8CDN8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc38Q8CDN8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc38Q8CDN8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc38Q8CDN8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc38Q8CDN8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc38Q8CDN8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc38Q8CDN8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc38Q8CDN8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc38Q8CDN8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc38Q8CDN8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc38Q8CDN8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc38Q8CDN8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc38Q8CDN8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc38Q8CDN8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc38Q8CDN8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc38Q8CDN8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc38Q8CDN8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc38Q8CDN8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc38Q8CDN8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc38Q8CDN8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms