Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CrebrfQ8CDG5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CrebrfQ8CDG5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CrebrfQ8CDG5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CrebrfQ8CDG5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CrebrfQ8CDG5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CrebrfQ8CDG5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CrebrfQ8CDG5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CrebrfQ8CDG5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CrebrfQ8CDG5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CrebrfQ8CDG5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CrebrfQ8CDG5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CrebrfQ8CDG5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CrebrfQ8CDG5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CrebrfQ8CDG5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CrebrfQ8CDG5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CrebrfQ8CDG5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CrebrfQ8CDG5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CrebrfQ8CDG5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CrebrfQ8CDG5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CrebrfQ8CDG5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CrebrfQ8CDG5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CrebrfQ8CDG5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CrebrfQ8CDG5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CrebrfQ8CDG5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CrebrfQ8CDG5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CrebrfQ8CDG5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CrebrfQ8CDG5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrebrfQ8CDG5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrebrfQ8CDG5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrebrfQ8CDG5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrebrfQ8CDG5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrebrfQ8CDG5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CrebrfQ8CDG5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CrebrfQ8CDG5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CrebrfQ8CDG5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CrebrfQ8CDG5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CrebrfQ8CDG5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CrebrfQ8CDG5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CrebrfQ8CDG5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CrebrfQ8CDG5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CrebrfQ8CDG5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CrebrfQ8CDG5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CrebrfQ8CDG5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CrebrfQ8CDG5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CrebrfQ8CDG5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CrebrfQ8CDG5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CrebrfQ8CDG5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CrebrfQ8CDG5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CrebrfQ8CDG5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CrebrfQ8CDG5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CrebrfQ8CDG5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CrebrfQ8CDG5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CrebrfQ8CDG5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CrebrfQ8CDG5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CrebrfQ8CDG5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms