Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samd4aQ8CBY1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samd4aQ8CBY1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samd4aQ8CBY1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samd4aQ8CBY1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samd4aQ8CBY1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd4aQ8CBY1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd4aQ8CBY1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd4aQ8CBY1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd4aQ8CBY1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Samd4aQ8CBY1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Samd4aQ8CBY1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Samd4aQ8CBY1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samd4aQ8CBY1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd4aQ8CBY1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd4aQ8CBY1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd4aQ8CBY1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samd4aQ8CBY1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd4aQ8CBY1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd4aQ8CBY1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd4aQ8CBY1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd4aQ8CBY1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd4aQ8CBY1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd4aQ8CBY1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd4aQ8CBY1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd4aQ8CBY1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Samd4aQ8CBY1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd4aQ8CBY1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd4aQ8CBY1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Samd4aQ8CBY1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms