Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nrip1Q8CBD1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nrip1Q8CBD1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nrip1Q8CBD1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nrip1Q8CBD1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nrip1Q8CBD1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nrip1Q8CBD1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nrip1Q8CBD1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nrip1Q8CBD1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nrip1Q8CBD1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nrip1Q8CBD1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nrip1Q8CBD1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nrip1Q8CBD1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nrip1Q8CBD1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nrip1Q8CBD1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nrip1Q8CBD1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nrip1Q8CBD1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nrip1Q8CBD1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nrip1Q8CBD1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nrip1Q8CBD1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nrip1Q8CBD1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nrip1Q8CBD1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nrip1Q8CBD1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nrip1Q8CBD1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nrip1Q8CBD1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nrip1Q8CBD1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nrip1Q8CBD1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nrip1Q8CBD1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nrip1Q8CBD1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nrip1Q8CBD1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nrip1Q8CBD1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nrip1Q8CBD1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nrip1Q8CBD1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nrip1Q8CBD1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nrip1Q8CBD1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nrip1Q8CBD1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nrip1Q8CBD1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nrip1Q8CBD1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nrip1Q8CBD1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nrip1Q8CBD1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nrip1Q8CBD1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nrip1Q8CBD1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nrip1Q8CBD1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nrip1Q8CBD1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nrip1Q8CBD1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nrip1Q8CBD1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nrip1Q8CBD1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nrip1Q8CBD1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nrip1Q8CBD1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nrip1Q8CBD1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nrip1Q8CBD1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nrip1Q8CBD1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nrip1Q8CBD1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nrip1Q8CBD1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nrip1Q8CBD1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nrip1Q8CBD1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nrip1Q8CBD1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nrip1Q8CBD1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nrip1Q8CBD1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nrip1Q8CBD1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nrip1Q8CBD1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nrip1Q8CBD1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nrip1Q8CBD1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nrip1Q8CBD1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nrip1Q8CBD1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nrip1Q8CBD1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrip1Q8CBD1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrip1Q8CBD1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrip1Q8CBD1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrip1Q8CBD1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nrip1Q8CBD1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrip1Q8CBD1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrip1Q8CBD1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrip1Q8CBD1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrip1Q8CBD1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nrip1Q8CBD1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nrip1Q8CBD1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrip1Q8CBD1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrip1Q8CBD1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrip1Q8CBD1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms