Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atxn7l2Q8C8K6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn7l2Q8C8K6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn7l2Q8C8K6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn7l2Q8C8K6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atxn7l2Q8C8K6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms