Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4bp3Q8C7U1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4bp3Q8C7U1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4bp3Q8C7U1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4bp3Q8C7U1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
N4bp3Q8C7U1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
N4bp3Q8C7U1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
N4bp3Q8C7U1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
N4bp3Q8C7U1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
N4bp3Q8C7U1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
N4bp3Q8C7U1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
N4bp3Q8C7U1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
N4bp3Q8C7U1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
N4bp3Q8C7U1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
N4bp3Q8C7U1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
N4bp3Q8C7U1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
N4bp3Q8C7U1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
N4bp3Q8C7U1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
N4bp3Q8C7U1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4bp3Q8C7U1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4bp3Q8C7U1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
N4bp3Q8C7U1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
N4bp3Q8C7U1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
N4bp3Q8C7U1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
N4bp3Q8C7U1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
N4bp3Q8C7U1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
N4bp3Q8C7U1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
N4bp3Q8C7U1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
N4bp3Q8C7U1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4bp3Q8C7U1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
N4bp3Q8C7U1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
N4bp3Q8C7U1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
N4bp3Q8C7U1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
N4bp3Q8C7U1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
N4bp3Q8C7U1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
N4bp3Q8C7U1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
N4bp3Q8C7U1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
N4bp3Q8C7U1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4bp3Q8C7U1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4bp3Q8C7U1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4bp3Q8C7U1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
N4bp3Q8C7U1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4bp3Q8C7U1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
N4bp3Q8C7U1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
N4bp3Q8C7U1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
N4bp3Q8C7U1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
N4bp3Q8C7U1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4bp3Q8C7U1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4bp3Q8C7U1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
N4bp3Q8C7U1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4bp3Q8C7U1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4bp3Q8C7U1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
N4bp3Q8C7U1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
N4bp3Q8C7U1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
N4bp3Q8C7U1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
N4bp3Q8C7U1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
N4bp3Q8C7U1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
N4bp3Q8C7U1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4bp3Q8C7U1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
N4bp3Q8C7U1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
N4bp3Q8C7U1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4bp3Q8C7U1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4bp3Q8C7U1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4bp3Q8C7U1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
N4bp3Q8C7U1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4bp3Q8C7U1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
N4bp3Q8C7U1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
N4bp3Q8C7U1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
N4bp3Q8C7U1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
N4bp3Q8C7U1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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