Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rft1Q8C3B8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rft1Q8C3B8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rft1Q8C3B8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rft1Q8C3B8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rft1Q8C3B8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rft1Q8C3B8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rft1Q8C3B8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rft1Q8C3B8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rft1Q8C3B8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rft1Q8C3B8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rft1Q8C3B8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rft1Q8C3B8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rft1Q8C3B8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms