Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q8C1R3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q8C1R3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q8C1R3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q8C1R3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q8C1R3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q8C1R3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8C1R3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q8C1R3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q8C1R3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q8C1R3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q8C1R3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q8C1R3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q8C1R3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8C1R3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8C1R3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8C1R3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8C1R3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8C1R3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8C1R3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Q8C1R3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Q8C1R3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q8C1R3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q8C1R3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q8C1R3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q8C1R3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8C1R3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8C1R3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q8C1R3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q8C1R3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q8C1R3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q8C1R3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Q8C1R3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q8C1R3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8C1R3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8C1R3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q8C1R3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q8C1R3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q8C1R3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8C1R3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8C1R3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8C1R3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8C1R3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8C1R3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q8C1R3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q8C1R3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q8C1R3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q8C1R3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q8C1R3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q8C1R3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q8C1R3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q8C1R3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q8C1R3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q8C1R3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Q8C1R3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q8C1R3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q8C1R3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q8C1R3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Q8C1R3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q8C1R3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q8C1R3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q8C1R3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q8C1R3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q8C1R3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q8C1R3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q8C1R3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q8C1R3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8C1R3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8C1R3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8C1R3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8C1R3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8C1R3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q8C1R3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q8C1R3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Q8C1R3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q8C1R3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q8C1R3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q8C1R3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q8C1R3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q8C1R3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms