Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx22Q8C084 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Snx22Q8C084 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx22Q8C084 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx22Q8C084 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx22Q8C084 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx22Q8C084 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx22Q8C084 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx22Q8C084 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx22Q8C084 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx22Q8C084 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx22Q8C084 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx22Q8C084 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx22Q8C084 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx22Q8C084 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx22Q8C084 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms